Assassin's Creed franšizė visada pasakojo savo istoriją žudiko ordino požiūriu. Tamplierių ordinui palaikant taiką pašalinant laisvą valią, visada buvo aišku, kas yra teisus. Tačiau yra vienas pavadinimas pademonstravo perspektyvą Tamplierių ordino - ir kaip vienas apykaklė vos nesunaikino Kolonijinės žudikų brolijos.
„Assassin's Creed Rogue“ pristatė jauną žudiką Shay Patricką Cormacą, kuris prieš pat Septynerių metų karą buvo Amerikos brolijos narys. Jam ir jo draugui Liamui O'Brienui buvo pavesta medžioti dirbinius, kurie, Ordino manymu, buvo pririšti prie Edeno gabalų. Jie egzistavo ilgai prieš išpažinties išpažinimą ir turėjo tokią didelę galią, kad jei tamplieriai įgytų nors vieno iš jų kontrolę, jie galėtų pavergti visą žmoniją.
Pora sugebėjo surasti vieną dirbinį senovinėje šventykloje po Lisabona. Tačiau jo imdamasis Shay sukėlė žemės drebėjimą, per kurį žuvo ir įstrigo tūkstančiai žmonių. Ši patirtis privertė jį manyti, kad žudikai nekalti nekaltų, dabar juos vertina kaip priešingus herojams, kuriuos jis manė esant. Shay'as atsisuko ordinu, sukeldamas pavojų jo gyvybei, kai jo draugai medžiojo. Galų gale jis rado kelią į Kolonijinio ordino apeigas, o iš ten jis stojo prieš prisiekusio Assassino priešą ir pažadėjo, kad jo seni draugai niekada neras kitos šventyklos.
Per septynerių metų karą Shay sumedžiojo savo senus žudiko partnerius su tamplierių didmeistriu Haythamu Kenway. Haythamas buvo piratų žudiko Edwardo Kenway sūnus, tačiau jis buvo užaugintas sekti tamplieriais. Bėgant metams Haythamas ir Shay'as įgijo tvirtą pagrindą kolonijose ir laimėjo septynerių metų tamplierių karą. Jis taip pat pašalino kai kuriuos galingiausius Kolonijinės brolijos narius.
Kulminacija „Assassin's Creed Rogue“ matė, kaip Shay nužudė savo seną draugą Liamą ir Haythamą, suluošino jų lyderį Achilą Davenportą. Septynerius metus žudikai buvo neorganizuoti ir be vadovavimo, nes Šėjus ir Tamplieriai kontroliavo kolonijas iš šešėlio. Nepraeitų dar septyneri metai, kol Haythamo sūnus Connoras atvyks ir tęsis ten, kur Achilas nutraukė, pašalindamas tamplierių grėsmę Amerikoje ir padėdamas šalies pergalei prieš Didžiosios Britanijos karūną per vieną svarbiausių istorijos konfliktų - Amerikos revoliuciją.
Kormakas toliau dirbo su Tamplierių ordinu, medžiodamas senovinius dirbinius, kurie padėtų jiems įgyti pranašumą prieš žudikus. Kai Connoras išlaisvino kolonijas, Shay buvo Paryžiuje, jo užduotis buvo nužudyti Assassiną, kuris laikė šventą dėžę, kuri galėjo atrakinti senovės paslaptis ir egzistavo dar Kinijos žudikas Shao Jun. Jo nužudytas žudikas buvo Arno Doriano, žudiko, kuris padėtų išvaduoti Paryžių, tėvas „Assassin's Creed Unity“ . Nors Shay Cormacas visiškai nesunaikino Amerikos žudikų brolijos, jis parodė, kaip greitai jie gali suskaidyti, kai vienas iš jų persikelia į kitą pusę.
